Согласно сюжету, божество, известное под именем «Дэус Экс Макина» и
повелевающее пространством и временем, доживает свои последние дни. А так как
мир не может существовать без своего бога, он погибнет вместе с Дэусом. По
этой причине Дэус устраивает игру на выживание. Последний выживший игрок
займет его место. При этом дневник каждого из двенадцати игроков превращается
в «Дневник будущего» (яп. 未来日記 Мирай Никки). Каждый такой дневник содержит
записи, выглядящие так, как будто их написал сам владелец, но относящиеся к
будущему. Например, если ранее игрок описывал в своем дневнике побеги, дневник
будет предсказывать его будущие побеги от опасности. Однако, если дневник
игрока пострадает, будущее игрока исчезнет, а от самого игрока не останется
даже трупа.
История вращается вокруг первого и второго игроков, Юкитэру Амано и влюблённой
в него Юно Гасай. Юкитэру нелюдим и имеет только двух воображаемых друзей --
Дэуса и его помощницу, Мурумуру. Его дневник описывает всё, что происходит
вокруг Юкитэру, и таким образом является наиболее информативным среди
остальных. Вместе с тем сам Юкитэру слаб и не может противостоять своим
противникам самостоятельно. Поэтому его телохранителем становится Юно, чей
дневник описывает всё происходящее с её возлюбленным. Так или иначе, сюжет
затрагивает три альтернативные реальности, созданные путешествиями во времени.
Однако события разворачиваются в основном во втором мире.